战舰帝国中的重点系统就是码头，为什么这么说呢，因为战舰帝国中的玩家的战舰都是放在码头里的，以及战舰的升级、训练和退役。玩家们如果有足够的舰船图纸和金币时可以改造船只，提升舰船成长属性。这里给个信息：+2的紫色舰船(以下简称紫舰)除开技能，其他属性都比没有改造过的白板橙色舰船。
战舰的升级也是提升舰船基本属性。有足够金币就可以升级。战舰等级不能高于自身等级。玩家们可以升级主动技能和旗舰技能，点击可以花费技能书进行“拼脸式”有概率的升级。注意：技能升级失败时会增加熟练度，熟练度满了以后依旧可以升级。
战舰也是需要训练的哦!有足够训练弹药即可。训练分为花5弹药、2w金币+3弹药、20钻+1弹药3种方式，级别依次上升。玩家们.每次点了训练，花费弹药以后属性点出现加成，必须立刻点一次保存属性，否则一切白搭。